Trong số tiền hơn 30.000 tỷ đồng sai phạm, Thanh tra Chính phủ cho biết đã kiến nghị thu hồi về ngân sách Nhà nước 3.712 tỷ đồng, kiến nghị các cơ quan có thẩm quyền xem xét, xử lý số tiền còn lại (27.008 tỷ đồng), đồng thời kiến nghị tổ chức kiểm điểm trách nhiệm các tập thể, cá nhân có những vi phạm liên quan.
Trong quý 1/2012, Thanh tra Chính phủ đã ban hành 11 kết luận thanh tra tại một số tập đoàn nhà nước như Tập đoàn Hóa chất Việt Nam, Tập đoàn Dầu khí Việt Nam, Tập đoàn Viễn thông quân đội; thanh tra trách nhiệm của Bộ Xây dựng trong việc thực hiện chức năng quản lý nhà nước về nhà ở; thanh tra Tập đoàn Sông Đà, Đại học Quốc gia TP Hồ Chí Minh; công tác quy hoạch, quản lý sử dụng đất, quản lý đầu tư xây dựng và một số dự án đầu tư xây dựng tại Kiên Giang và thanh tra trách nhiệm thực hiện pháp luật về khiếu nại, tố cáo và phòng chống tham nhũng tại các tỉnh Tuyên Quang, Tiền Giang và Bến Tre.
Liên quan đến sai phạm của Tập đoàn Dầu khí Việt Nam (PVN), ông Ngô Văn Khánh – Phó tổng Thanh tra Chính phủ cho biết, Thủ tướng đã đồng ý với các kiến nghị sau thanh tra. Thanh tra Chính phủ nêu rõ, PVN đã sử dụng trên 15.000 tỷ đồng tiền lãi dầu khí nước chủ nhà để lại cho các hoạt động tài chính không thuộc các dự án trọng điểm dầu khí là chưa đúng với quy định pháp luật.
Ngoài ra, tập đoàn này còn mua tàu khảo sát địa chấn 2D đã quá 10 năm so với quy định đăng kiểm nhưng không báo cáo cơ quan chức năng. Việc PVN chuyển nhượng một số tài sản lớn như tàu thăm dò địa chấn, khách sạn Du lịch Thái Bình… cũng không đảm bảo thủ tục và có sai sót.
Thanh tra Chính phủ đã kiến nghị Thủ tướng giao các bộ, ngành thu hồi khoản tiền trên 1.600 tỷ đồng mà PVN cho các đơn vị bên ngoài ứng vốn để đầu tư nhưng không có kế hoạch trả nợ hoặc không có khả năng thanh toán, đồng thời yêu cầu PVN xử lý khoản tiền vi phạm lên tới hơn 18.000 tỉ đồng.
Liên quan đến trách nhiệm của Bộ trưởng GTVT Đinh La Thăng trong thời gian làm Chủ tịch Hội đồng thành viên PVN (2006-2011), Phó tổng Thanh tra Chính phủ Ngô Văn Khánh cho biết, việc xem xét trách nhiệm của tập thể, cá nhân trong các sai phạm đang được thực hiện nghiêm túc và sẽ công khai.
Việt Nguyễn