Ông cũng thắc mắc, tại sao Bộ Tài chính không tính đến phương án tiếp tục áp dụng Pháp lệnh thuế Thu nhập cao trước đây và lùi thời hạn thi hành Luật thuế Thu nhập cá nhân đến năm 2010?
Ủy ban Tài chính - Ngân sách Quốc hội đồng tình với phương án miễn số thuế thu nhập cá nhân đã được giãn thuế trong 6 tháng đầu năm. Tuy nhiên, vẫn còn nhiều ý kiến tranh cãi về việc có tiếp tục miễn, giảm thuế 6 tháng còn lại hay không. Các ý kiến phản đối việc miễn, giảm thuế cho rằng việc giảm thuế sẽ làm ảnh hưởng không nhỏ đến nguồn thu cho ngân sách Nhà nước và chưa bảo đảm tính hợp lý trong việc điều tiết thu nhập của cá nhân. Tuy nhiên, theo các chuyên gia kinh tế, việc một năm có hai cách tính thuế này sẽ gây ra không ít khó khăn, bất cập.
Ông Nguyễn Minh Phong cho rằng, việc áp dụng một năm hai cách tính thuế này trước hết sẽ khiến việc hạch toán khó khăn, đặc biệt, trong bối cảnh hệ thống mã số thuế chưa được cấp hết hiện nay. Thứ hai, sẽ có những bất cập nảy sinh, như với một số người có những khoản thu nhập do tích luỹ từ đầu năm nhưng đến cuối năm mới được nhận. Khi đó, có thể xảy ra trường hợp 6 tháng đầu năm được miễn giảm thuế thu nhập thì họ không có thu nhập chịu thuế, tức là không được hưởng lợi từ chính sách hỗ trợ.
Đến 6 tháng cuối năm khi không còn được miễn, giảm nữa họ lại phải chịu thuế thu nhập từ khoản thu nhập tích luỹ từ đầu năm. Hoặc ngược lại, những người có thu nhập tập trung vào đầu năm, lúc được miễn thuế sẽ được hưởng lợi lớn. Như vậy, rõ ràng việc một năm áp dụng hai cách tính thuế sẽ khó đảm bảo công bằng.
Mặt khác, cũng theo ông Phong, trong năm nay kích cầu là một mục tiêu chủ đạo của Chính phủ, việc giảm thuế, miễn thuế cũng nằm trong mục tiêu này. Nếu tiếp tục thu thuế theo cách mới thì có thể sẽ làm tổn hại đến mục tiêu kích cầu. Ông Phong cho rằng: “Không nên vì so đo một vài nghìn tỷ mà ảnh hưởng đến mục tiêu chung. Mặt khác, nếu vội vã thu có thể dẫn đến những kẽ hở và khoản thất thu có thể còn cao hơn nhiều”.
Ông Phong đề nghị: Tốt nhất nên tiếp tục thu thuế Thu nhập cao như trước đây và lùi thời hạn thi hành Thuế thu nhập cá nhân sang năm sau. Mới đây TP HCM cũng đã kiến nghị nên lùi hiệu lực thi hành Luật thuế Thu nhập cá nhân đến 1/1/2010. Nhưng đồng thời TP HCM cũng đề nghị nên quy định cụ thể về mức thu nhập chịu thuế được miễn, giảm thuế, tránh trường hợp cào bằng, miễn giảm cho cả các đối tượng có thu nhập cao, gây thất thu cho ngân sách, vì bản chất của thuế thu nhập cá nhân là điều tiết thu nhập để tạo sự công bằng trong xã hội.
Đắc Kiên